防水混凝土工程质量除精心设计、合理选材外，关键还要保证施工质量。对施工中的各主要环节，如混凝土的搅拌、运输、浇筑振捣、养护等，均应严格遵循施工及验收规范和操作规程的规定进行施工，以保证防水混凝土工程的质量。
防水混凝土工程的模板应平整且拼缝严密不漏浆并有足够的强度和刚度，吸水率要小。一般不宜用螺栓或铁丝贯穿混凝土墙固定模板，当墙高需要用螺栓贯穿混凝土墙模板时，应采取止水措施。一般可在螺栓中间加焊一块100mm*100mm的止水钢板，止水钢板，阻止渗水通道。
为了阻止钢筋的引水作用，迎水面防水混凝土其钢筋保护层厚度不得小于30mm，底板钢筋均不能接触混凝土垫层。墙体的钢筋不能用铁钉或铁丝固定在模板上。严禁用钢筋充当保护层垫块，以防止水沿钢筋侵入。
防水混凝土应用机械搅拌、机械振捣，浇筑时应严格做到分层连续进行，每层厚度不宜超过300~400mm.两层浇筑时间间隔不应超过2h，夏季适当缩短。混凝土进入终凝(一般浇后4~6h)即应覆盖，浇水湿润养护不少于14d。
尽管理想状态的混凝土可阻止水的侵入，但混凝土因某些潜在的缺陷，并不能在其寿命期内内完全防止水分渗透。这些缺陷发生在初始浇筑阶段，也可能发生在混凝土寿命期内。混凝土容易渗水，因此对混凝土进行防水是非常必要的。
地下混凝土表面需要防水有以下几个原因。最主要的一点是为了防止水分渗透到建筑物内。另外，做防水也可以保护建筑结构破坏或预埋钢筋腐蚀。混凝土是一种多孔材料，水分可通过静水压、水汽梯度或毛细作用渗透到其内部。水也能进入裂缝、结构缺陷或设计施工不当的连接处。防水也可以因施工现场内外化学物质引起的混凝土品质下降。
混凝土结构需要防水以防止水分渗入设施内，保护混凝土结构本身和预埋的钢筋。一个明显的问题是混凝土在硬化后会开裂，裂缝使水分容易渗入。硬化前，混凝土可能由于结构位移、塑性变形、干缩或早期霜冻而开裂。硬化后，混凝土则可能由于沉降、震动、徐变、超载或因地基土移动造成的倾斜而开裂。
除了混凝土本身是多孔性材料之外，混凝土结构还有许多极易渗水的部位，包括所有混凝土接缝处、控制缝和膨胀缝。渗水的口子也可能发生在拉杆孔、穿孔部位和结构连接处。混凝土内部排水管也是极易渗透的地方。
关于迎水面防水盒背水面防水，要始终牢记防水的目的为了保护混凝土整个结构。而背水面防水达不到这个目的。为了有效的防水，防水通常应当做在直接承受静水压面上的防水系统都有可能被渗水混凝土的水汽或水从混凝土基层上冲开、剥落。背水面还容易将地下水中的污染带人混凝土内。
影响防水系统的另一个重要因素是混凝土表面的质量。光滑的基面应该无蜂窝麻面、凹槽、漏洞、灰尘、泥土、油污或者其他污染物。光滑的基面为了防水材料提供了连续可靠的支撑，并且保证了防水卷材与基层之间的良好粘结力。因此防水系统是否成功依赖于混凝土面层的处理情况。
水压如果作用在没有支撑的防水材料上，会使材料受挤、变形进而破裂。如果防水卷材或者混凝土表面有裂缝或者缺陷，那么，混凝土表面和防水卷材之间良好的粘结力，对于防止水的渗入和渗漏十分必要。模板隔离剂、脱模剂和混凝土的养护膜可以影响粘结力的形成。在防水施工之前，要清除掉这些物质。
但上述提高致密性途径是以增强混凝土刚性，降低柔性(抗折强度)，上升干缩开裂危险等来实现。提高了混凝土防水抗渗性，同时也降低了混凝土服役期的弹性疲劳耐久性。因此，提高混凝土抗渗性能是有限的，特别是在大面积施工中，施工伸缩缝、沉降缝以及处理不同环境条件下的混凝土建筑物等，依靠混凝土自防水是达不到防水要求的，需要根据混凝土建筑物防水要求和所处于环境做特定的处理。