工程竣工结算是由施工单位做的，是施工单位得到工程款项的重要依据。施工单位应在工程竣工验收合格后的一定工作日内，向建设单位递交竣工结算报告及完整的结算资料。这里的结算资料是指对施工单位完成的全部工作价值的详细结算，以及根据合同条件对应付给施工方的其他费用的合计。主要包含建筑工程费、安装工程费及合同规定给施工方的其他费用。经过审查核定后的工程竣工结算是核定建设工程造价的依据，也是建设项目验收后编制竣工决算和核定新增固定资产价值的依据。
工程竣工决算是由建设单位做的，是在项目竣工以及施工单位提交竣工结算报告及结算资料后，建设单位报告全部建设费用、建设成果和财务情况的总结性文件。建设项目竣工决算应包括从筹划到竣工投产全过程的全部实际费用，即建筑工程费、安装工程费、设备工器具购置费、工程建设其他费用（含征地费、补偿费、各种许可证费、建设单位管理费、监理费、勘查设计费、调试费等等）、预备费、建设期贷款利息等。竣工决算反映了竣工项目计划、实际的建设规模、建设工期以及设计和实际的生产能力，反映了概算总投资和实际的建设成本，同时还反映了所达到的主要技术经济指标。通过对这些指标计划数、概算数与实际数进行对比，不仅可以全面掌握建设项目计划和概算执行情况，而且可以考核建设项目投资效果，为今后制定基建计划，降低建设成本，提高投资效果提供必要的资料。
从以上可以看出，工程竣工决算是一个工程从无到有的所有相关费用，而工程竣工结算是一个实体工程的建筑和安装工程费用。工程竣工决算包含了工程竣工结算的内容，而工程竣工结算是工程竣工决算的一个重要组成部分。