1 如何识别环境因素及分析环境工程管理所存在的问题
1.1 缺少对重要环境因素的科学、系统及全面的观测，使得重大环境因素的目标与指标的制定困难，并且在实施过程中，软指标比较多，而硬指标却比较少，使得在目标与指标的落实执行时，各个方面，包括机构、资金、职责、方法、监督检测手段及必需的程序文件等主观条件不能很好地与实施细则进行协调配合，落实配套，达成基本一致。
1.2 在这个棘手的问题上，缺少专业的优秀的技术人员，是我们不得不面对的又一个严峻的挑战。环境工程在我国还没有引起充分的认识和重视，并且它也还没有被广大人民群众所接受，所深入去了解，所以从传统意义上讲，它并没有形成独立的学科。在全国各大院校中，境工程专业化的培养还极少，所以环境专业化方面的人才更是鳞次栉比。并且由于资金和技术等方面的不完善，也没有很好的岗位培训的机会提供给环境工程方面的在职人员。与之相关的诸多问题都对环境工程专业学科的进一步发展和提高有所妨碍。
1.3 没有大力加强宣传力度，间接地造成了资源的浪费。
1.4 对环境管理意识的缺乏，以及站网和实验室管理的自动化程度低。人们没有形成这方面的相关意识，是我们面对的挑战和危机，但同时，政府与社会并不高的监督力度，也成为了我们这一问题的刽子手。很多制度只是虚有其表，例如一票否决制度；环境保护工作一般化管理多，而规范化系统化的管理不够；这些制度通常或是与我们的制度背道而驰，或是远远地脱离了我们生活的预定轨道，在实际的实施中，操作性也极差。
2 强化环境工程管理控制的措施
2.1 提高广泛的意识，充分调动资金储备。在现在这个与环境相关的工作还没有被我国人民深入地了解与认同的时代背景下，我们更应该引导和促进改变观念，由小及大，以保证环境工程工作更好地、更高效地落实。与此同时，加大资金投入力度。我们始终贯彻从实际出发，去了解、分析问题，于是提出具有针对性的改革建议，制定高标准、高质量的管理体制，让环境工程更好地服务于人民，更有效地保障人民的高层次的生活标准，以此得到相关管理层的高度认可和重视。
2.2 要注意充分地将管理体系与现行的环境综合治理中环境保护模范城市、模范企业结合，将这些城市或企业等的综合治理及其实施的定量考核的指标体系与考核办法作为模板和依据，为实现环境的综合治理寻求到方法和途径。
2.3 建立并完善环境工作相关法规和管理条例，通过如制定环境工程工作管理规定、试验工作管理规定和实验室（试验网站）管理规定等。实地考察，因地制宜，充分利用各处的环境资源，使条例法规人文化、明确化和具体化，并且可操作性强。同时要提高相关工作人员的工作效率，通过工作人员指定的具体计划，结合合理的策划，高效地精确地完成工作。当项目被有关部门批准后，一定要按照计划实施，且应由有关部门和人员在任务执行过程中进行监督和检查，并在适当的时候进行考核和评审。计划的相关信息，包括任务完成的情况，任务执行过程中得到的各种有用信息以及任务目前的状况对今后工作的影响等都要记录并输入有关的决策文件中，供环境管理部门和人员做为决策用的重要依据。
2.4 充分地将管理体系与具体的建设、规划和改造目标相结合。作为进行环境管理的基础依据，环境的建设、规划和改造目标在环境保护工作中着实被赋予了名副其实的不可忽视的力量。
2.5 从国情出发，加强学生队伍的团队建设，大力培养本科生、研究生，加强各专业、各学科的相互融合，有针对性地培养高素质技术人才，储备专业技术力量，以满足日新月异的社会发展和市场需求。积极开展环境工程培训，提高人员环境保护认识。让大家清楚地认识到我们就是这个问题的主人，鼓励职工教育制度化、规范化和正规化，我们可以通过奖惩条例更加提高职工的知识水平、工作能力和自身素质。
2.6 尽一切努力去大力宣传一切信息，例如开设专门的网站宣传试验站网和实验室的工作、能力，在引起广大人民群众的高度关注的同时，扩大环境工程工作的影响力，推广先进成熟的经验和成果。
3 加强与完善环境工程管理体系的措施
3.1 要达到管理的真正目的，就要求管理体系要和现行组织机构结合，最大限度地发挥环境管理职能，假使达不到这样的要求的环境，那我们就要想尽一切办法来完善工作环境。
3.2 管理体系要和现行的环境综合治理中环境保护模范城市模范企业结合，参照这些城市或企业等的综合治理及其实施的定量考核的指标体系与考核办法，为环境的整体治理找到有效的政策与措施。
3.3 在对现行的环保制度进行评估的同时，扩充环保体系的内容，将合理的要求及制度都充分地收入其中，征求民意，筛选意见。对于尚未完善以及不符合标准的制度予以完善和修改，并废除阻碍环保工作开展的制度。尽一切力量将管理体系和现行的环境管理制相结合。
3.4 实施资源的优化配制，将管理体系和工业结构的调整经济增长方式的转变相结合，有效制止低水平的重复建设，严格管理高耗能及重污染的项目，将企业清洁生产的计划与对策纳入到环境管理体系中，并对其进行严格地督促与监督。
3.5 管理体系要和国家及地方环保的工作重点相结合，确保环境的治理能按计划进行。
3.6 管理体系的运行与控制要和政府的行政管理相结合，现在很多部门、行业、各级组织对环境的保护意识以及管理水平都没达到要求和标准，因此很多法律、政策法规的贯彻执行还需要借助行政的手段来落实完成。
3.7 管理体系要和具体的建设规划和改造目标相结合。作为进行环境管理的基础依据的环境的建设规划和改造目标，在环境保护中起着举足轻重的作用。直接控制与间接控制的相结合才能保证环境管理体系的运行。政府要对其各部门的直属组织进行直接控制，但其具体部门应有所属具体的部门企业等完成，以此来达到政府的间接控制。环境工程管理在建立和运行一个管理系统中起着不可替代的作用，只有通过这个系统的高效率、高质量的运转，环境工程管理的规范性和有序性以及它的有效实施才能得以保证。为此必须组建相应的组织机构和采取一定的技术措施去保证实现各项环境工作的规范化和制度化。
环境工程管理工作对我国的未来发展举足轻重，但是目前在我国还并没有给与此项工作的高度重视和广泛关注。这除了各有关部门不够重视外，对环境工程管理的技术、方法和程序的研究不够深入以至于没有形成一套适用的、而又被各方接受的可以在工程项目上应用的管理办法成为了另一个重要却被忽视的原因。因此，加强环境工程管理方法的研究是相当重要并且刻不容缓的。