随着小型农田水利重点县建设进程的推进，全国高标准农田水利工程建设区域逐年拓宽，建设任务越来越重，各级政府及专家对高标准农田水利工程建设质量也越来越关切。高标准农田水利工程相应配套工程措施主要有以下几方面。
第一、农田土地工程
与高标准农田水利工程相配套的农田土地工程主要包括土地平整，田间布局模式等。土地平整工程建设标准要以节地、节水、省工，增产为总目标，尽量减少无效用地，提高土地有效利用率。
土地平整后田块相对集中，农田耕作田面应到达一定平整精度，旱作畦田田面平整精度( 相对于设计坡面的田面高程标准偏差) 应小于3 cm；水田区格田田面平整精度应小于2 cm；采用喷、微灌时，畦、格田内田面平整精度不宜大于15 cm；有条件的地区应推行激光平地。渠灌区田间布局原则上按一沟一渠一路布设，形成条田和格田。条田和格田规格首先必须满足农业机械化生产要求，其次需要考虑节水、节地和省工等综合效益，再次需结合当地的社会经济条件和耕作方式等来决定。最终形成“田成方，路相连、渠相通”的一种田间布局，达到机械进地有路可走，灌溉水流开关自如，田间作业方便、高效。
第二、农田林网工程
农田林网工程主要用于农田防风、改善农田气候条件、防止水土流失、促进作物生长和提供休憩庇荫场所的农田植树工程。按其功能可分为农田防风林、梯田埂坎防护林、护路林、护岸林等，应结合灌排沟渠布置进行布设。灌区农田防护林网控制面积占宜建林网农田面积的80%以上，并应预留农机进出田间的作业通道。风沙地区的防护林网和铁路路基、高压线附近的农田林网建设应符合国家现行标准。
第三、农田道路工程
农田道路工程是为满足农业物资运输、农业耕作和其他农业生产活动需要所采取的各种道路工措施，主要包括田间道和生产路。田间道是指连接田块与村庄，供农业机械、农用物资和农产品运输通行的道路。田间道路建设与林带、渠道、排水沟和居民点布置相结合，与乡、村公路连接，布局合理，密度、宽度等建设标准符合水利、交通、农机部分有关规范，路面宽度控制在3~7m，应配套必须的桥、涵等措施。生产路是指连接田块与田块、田块与田间道，供人力、畜力、小型农机通行的道路。生产路路面宽度应满足当地常用农业机具的交通要求，一般为2~3m，路基高于田面20~40 cm，可采用单车道。道路通达度平原区不宜低于95%，丘陵区不宜低于80% 。
第四、管理措施
高标准农田水利工程要可持续发挥工程效益,除了确保工程建设质量外，必须建立切实可行的运行管护机制。坚决杜绝重建设、轻管理，工程管理机构不健全，管理制度不完善、管理责任不落实，造成工程有人建，无人管，损坏后无人修的现象。高标准农田水利工程的管理技术与水平要与时俱进，随着社会经济的发展和农村劳动力的短缺，在经济发达有条件的地区可逐步实施农田水利工程管理信息化建设，实现工程运行管理自动化。坚决杜绝样板工程，在经济条件和技术水平达不到信息化管理可持续发展的地区，不建议盲目开展信息化建设。