工程审计中结算和决算的区别主要从两者的含义、两者的范围、两者的主体、两者的时间、两者的作用、两者依据法规、审计侧重点这七点方面分析，具体工程审计中结算和决算的区别分析如下：
第一、工程结算和工程决算含义不同
●工程结算含义：工程结算是指施工企业按照合同规定的内容全部完成所承包的工程，经验收质量合格，并符合合同要求之后，通过编制工程结算书向建设单位进行工程价款结算，是施工单位向建设单位索取工程报酬的依据。
●工程决算含义：工程决算应称作基本建设项目竣工财务决算，通过编制竣工决算书计算整个项目从立项到竣工验收、交付使用全过程中实际支付的全部建设费用, 反映了工程建设项目的最终造价，是正确核定新增固定资产价值、办理固定资产交付使用手续的依据。
第二、工程结算和工程决算的范围不同
●工程结算确定的是工程建设阶段的工程价款，包括建筑工程费、安装工程费等;
●竣工决算包括从筹集到竣工投产全过程的全部实际费用，即包括建筑工程费、安装工程费、设备工器具购置费用及预备费以及监理费、设计费、建设单位管理费等费用。
第三、工程结算和工程决算的主体不同
●工程结算是在建设单位和施工单位之间进行，有两个平等的主体;
●工程决算是由建设单位对工程项目发生的费用进行归集、分配、汇总编制，只有一个主体。
第四、工程结算和工程决算的时间不同
工程结算发生在工程决算之前，只有工程结算完成后，才能进行工程决算。
第五、工程结算和工程决算的作用不同
●工程结算是施工单位向建设单位索取工程报酬的依据，反映的是项目建设阶段的工作成果;
●工程决算是正确核算新增固定资产价值，考核分析投资效果，反映的是综合、全面、完整的项目建设的最终成果。
第六、工程结算和工程决算的依据法规不同
目前，工程结算的编制主要依据财政部、建设部联合发布的《建设工程价款结算暂行办法》;
工程决算的编制主要依据财政部发布的《基本建设财务管理规定》。
第七、工程结算和工程决算的审计侧重点不同
工程结算审计主要侧重于工程造价审计;
工程决算审计包含了对工程及财务等全部建设费用的审计。
工程结算与工程决算有区别也有联系
两者都是是工程建设领域常用的两个重要概念，也是政府投资建设项目审计的两项主要内容。工程竣工结算与决算是建设工程估算、概算、预算、结算、决算“五算”中的最后两个环节，工程结算与决算最终反映建设项目实际工程造价和建设情况的综合体现，工程结、决算涉及诸多主体、环节与内容，能够对实际建设情况的质量、真实、完整、全面地反映、评价等经行反映。
工程结算与工程决算主要联系体现在工程结算和工程决算都是政府投资建设项目审计的重点内容;工程结算与工程决算项目建设单位都是工程结算和工程决算共同的主体;工程结算是工程决算的组成部分，工程结算是决算的基础工程结算与工程决算主要体现联系体现在工程结算和工程决算都是政府投资建设项目审计的重点内容;工程结算与工程决算项目建设单位都是工程结算和工程决算共同的主体;工程结算是工程决算的组成部分，工程结算是决算的基础，工程结算应按照决算的要求，在相关内容上与决算保持一致。