《条例》第五十七条第二款规定“招标人最迟应当在书面合同签订后5日内向中标人和未中标的投标人退还投标保证金及银行同期存款利息。”，这里关于退还保证金及银行同期存款利息，笔者认为具有较大的操作困难。
在既有的法规中，《政府采购货物和服务招标投标管理办法》(财政部令第18号，以下简称“财政部18号令”)第三十七条规定“招标采购单位应当在中标通知书发出后五个工作日内退还未中标供应商的投标保证金，在采购合同签订后五个工作日内退还中标供应商的投标保证金。招标采购单位逾期退还投标保证金的，除应当退还投标保证金本金外，还应当按商业银行同期贷款利率上浮20%后的利率支付资金占用费。”对于招标采购单位应该按期退还投标保证金做出规定，并对于未按期退还做出惩罚性规定，是一种较为妥善并且具有实际操作性的处理办法。
一、投标保证金作用：
对投标人的投标行为产生约束作用。保证招标投标活动的严肃性
招标投标是一项严肃的法律活动，招标人的招标是一种要约邀请行为。投标人作为要约人，向招标人(要约邀请方)递交投标文件之后，即意味着响应招标人发出的要约邀请。在投标文件递交截止时间至招标人确定中标人的这段时间内，投标人不能要求退出竞标或者修改投标文件；而一旦招标人发出中标通知书，作出承诺，则合同即告成立，中标的投标人必须接受，并受到约束。否则，投标人就要承担合同订立过程中的缔约过失责任，就要承担投标保证金被招标人没收的法律后果。这实际上是对投标人违背诚实信用原则的一种惩罚。所以，投标保证金能够对投标人的投标行为产生约束作用，这是投标保证金最基本的功能。
二、招投标中的投标保证金该如何退还？
1、确定中标单位后，经办部门填写投标保证金退还申请单，由经办部门经理(总监)、公司总经理审批后，办理退还保证金事宜。
2、未中标单位的保证金退还：经办部门将投标保证金退还申请交到财务部，投标单位携收据5日内办理退还投标保证金退还事宜。
3、投标单位的保证金的退还：中标单位待合同签订后，携收据5日内办理退还保证金事宜。