沉井下沉采用挖土法下沉。人工挖土，挖土应分层、均匀、对称地进行，使沉井能均匀竖直下沉。下沉系数较大时，先挖中间部分，沿沉井刃脚周围保留土堤，使沉井挤土下沉。下沉系数较小时，先根据情况分别采用泥浆润滑套、空气幕或其他减阻措施，使沉井连续下沉，避免长时间停歇。井孔中间宜保留适当高度的土体，不得将中间部分开挖过深。
沉井下沉过程中，如井壁外侧土体发生塌陷，应及时采取回填措施，以减少下沉时四周土体开裂、塌陷对周围环境的影响。
沉井下沉过程中，每8h至少测量2次。当下沉速度较快时，应加强观测，如发现偏斜、位移时，应及时纠正。
从沉井中间开始逐渐挖向四周，每层挖土厚0.4m，沿刃脚周围保留0.5m土堤，然后再沿沉井壁，每2m一段向刃脚方向逐层全面、对称、均匀地削薄土层，每次削5cm，当土层经不住刃脚的挤压而破裂，沉井便在自重作用下均匀垂直挤土下沉，使不产生过大倾斜。如下沉很少或不下沉，可再从中间向下挖0.4m，并继续向四周均匀掏挖，使沉井平稳下沉。
普通土层中下沉开挖方法沉井内土方运出通常采用的方法是：在沉井边设置起重设备，将土装入斗吊斗内，用起重机吊出井外卸入自卸汽车运至弃土处。
沉井内土方吊运出井时，对于井下操作工人必须有安全措施，防止吊斗及土石落下伤人。