洪水浸泡或底部淘刷易造成渠道沉陷或塌陷。未经压实的新建土渠往往会发生全面沉陷，黄土渠道下沉现象尤为严重，旧渠上也会出现垂直沉陷段或深坑。出现这种情况应及时进行锥探，探清隐患深度及范围后及时灌浆堵塞或重新翻修夯实。在第一次放水时要注意观察处理的结果，如仍有沉陷，应再进行处理。
如沉陷不规律，堤脚下游地面隆起，应采取消顶卸荷、减缓堤坡和增设镇压平台等紧急措施，必要时还应加设排水井。这些处理措施都应在渠道水位缓降的情况下实施，不得用骤降渠道内水位的方法进行抢修。对由于蚁穴造成的塌陷，应先将塌陷部分挖开重新修筑，在日后的运行中应加强防治白蚁危害的措施。
渠道滑坡的修复
灌溉渠道经暴雨和洪水冲击发生滑坡的水毁现象比较普遍，多集中在深挖方渠道的内坡和高填方渠道的外坡，以及土质松软和风化岩石破碎地带，尤其是在强烈暴雨和大流量集中泄洪的情况下，更为严重。
滑坡的修复。首先需查明滑坡部位、程度、滑坡处及附近地段的断面变形情况，并分析原因。针对滑坡产生原因来制定修复方案，采取相应的处理措施，并计算出修复工作量。常用滑坡修复治理的方法有：
——滑坡发生在渠道外侧。恢复渠堤时，可采用局部放缓边坡的办法或做成复式断面，以增强其稳定性。
——滑坡发生在渠道内侧。如果原来的土质松软、稳定性差，可改用稳定性较好的土料修复，并提高其夯实、压密质量。必要时也可在恢复原断面的基础上进行局部的衬砌加固，以增强其防渗抗冲能力。特别是山区丘岭地带的高填方渠段，应采取防渗加固措施。
无论采取何种措施，都要坚持取用好土，切忌使用从渠道里挖出的淤泥填充补缺。这样的淤泥遇水极易流动，造成新的边坡滑塌，甚至破坏已做好的衬砌护面，给工程带来损失。此外，在寒冷地区防渗衬砌灌溉渠道的修复过程中，还应采取必要的防冻措施，以防止冻胀对渠道的破坏。
渠道滑坡的防治
一要加强滑坡段检查，有滑坡迹象时，及时采取削坡减压、砌石护坡、开沟排水等措施。二要完善山区排水沟的防洪措施，使汇集山坡的大量雨水，从截水沟或排洪槽等设施流出，保证排泄畅通。三要禁止在滑坡体脚取土、开石，以保持局部土体的稳定。四是渠道放水停水不能骤涨骤落，特别是大型土渠塑膜防渗渠道，更要防止骤然停水，那样易形成滑坡。
渠道裂缝的处理
渠道裂缝主要有横向和纵向两种。横向裂缝与渠道轴线垂直，一般危害性较大，必须认真处理。平行于渠线的纵向裂缝，如果不是坍坡引起的，一般问题不大，但也要认真处理，以免造成不良后果。处理方法主要有开挖回填法和灌浆法。
——开挖回填法。该方法是处理裂缝比较彻底的办法，适用于不太深的表层裂缝及防渗部位的裂缝。此办法有梯形楔入法和梯形十字法，其处理工序包括裂缝开挖和回填土料。
裂缝开挖工序：开挖长度应超过裂缝两端1m，开挖深度应超过裂缝深度0.3～0.5m，开挖槽底部宽度至少为0．5m。开挖前缝内应灌入白灰水，以便掌握开挖边界。较深坑槽应挖成阶梯形，以便出土和施工安全，开挖后应保护坑口，避免雨冲、日晒和冰冻，以防干裂、进水或冻裂。
回填土料工序：回填土料应视渠道土料及裂缝性质而定，对沉陷裂缝应选用塑性较大的土料，控制含水量大于最优含水量的1％～2％。对滑坡、干缩和冰冻裂缝的回填土料，应控制含水量等于或低于最优含水量的1％～2％，对于小裂缝可用原渠道土料回填。回填前应检查坑槽周围土体的含水量，偏干的应将表面湿润，过湿或冰冻的应清除后再进行回填。回填土应分层夯实，每次填土厚度以10～15cm为宜，一般要求压实厚度为填土厚度的2／3，回填土料的干容重，应比原土体稍大些。回填时，要将开挖坑槽的阶梯逐层削成斜坡，并进行刨毛，要特别注意将槽边角部位夯实。
——灌浆法。该方法适用于裂缝较深，开挖回填工程量大的裂缝处理。一般采用重力灌浆或压力灌浆，前者浆液靠自重灌入裂缝，后者除浆液自重外，再加机械压力，使浆液在较大的压力下灌入裂缝。灌浆的浆液可选用黏土或黄土泥浆。