一、灌溉制度不合理。用滴灌方式进行灌溉的用户，通常因为看不到灌水过程而让水过多的滴灌到土壤中，造成水资源浪费的现象，同时也会对植物不利；如果灌水时间较短，根系会由于水分不充足，发生水分胁迫，也不利于植物生长。提前熟悉灌溉系统的灌水强度、植物需水量和田间持水量，可以更好的对植物进行灌水方式控制，从而不浪费水，也不影响植物生长。还要根据植物不同的物候期，制定不同的灌溉制度，才能达到最优效果。
二、滴头的错误选择。通常会选择非压力补偿式的滴头，但是压力补偿式滴头效果会更好一些，即使价格上贵一些，产生的效果也是绝对可观的。压力补偿式滴头可以确保每一个滴头出水均匀，施肥灌溉统一。有些压力补偿式滴头流道很大，可以洗出滴头内的杂质，降低了滴头阻塞率。
三、不安装过滤设备。即使使用了较好的压力补偿式滴头，也要安装过滤系统。尤其对于井水而言，井水内经常含有粗砂或细砂和一些化学物质，非常容易阻塞滴头。常见的过滤器有很多类型，例如滤网、叠片、介质过滤器等。在安装过滤器之前，最好对水质的组成进行物理和化学分析，根据水质测定结果来选择合适的过滤器。
四、不通过滴灌系统施肥。滴灌最大的优点就是水肥同步施入，肥料效果也最好，这是由于植物根系生长具有向水、向肥性。但要注意安装肥料倒灌装置，防止肥料污染水源。
五、不注重日常维护。滴灌系统要精心维护才能发挥最优性能。需要经常冲洗滴灌管，保证水流通畅。还可周期性配合使用有效的化学方法处理。
六、没有压力表和流量表这些简单的设备。这些设备可以帮助使用者给灌溉系统“把脉”，以解决肉眼无法准确判断的滴灌系统问题。用压力表检测滴灌管首部、中部和尾部的压力情况，对比设计压力或水压的历史情况，可以判断滴灌系统的问题。流量计可以帮助使用者快速判断水源的流量，另外，流量数据有助于计算实际流量和灌溉系统的历史流量情况。
七、认为所有的滴灌管品质一样。殊不知不同的滴灌管有不同的原材料品质、生产工艺和专利技术，更重要的是不同品牌滴灌管的滴头结构设计是不同的。应该选择可以保证水肥均匀，抗阻塞性能高，寿命长，易于安装和维护的滴灌管。
八、忽视长期运行费用。有些滴灌系统往往要使用十几年或20年以上，灌溉数百万立方的水肥，所以提前考虑到灌溉的均匀度、泵站的运行费用以及日常维护费用非常重要。一个前期设计良好的系统，可通过其良好的均匀度或节能性降低后期运行成本。另外，一些供应商有很多经验和专有技术，可以指导使用者选用正确的灌溉系统，并在运行和维护系统方面提供必要的帮助。