河道受污染的方式主要可以分为以下几种：因水中营养物质过剩，譬如氮磷化合物，导致河水中藻类大量繁殖，发生赤潮现象，而藻类腐烂会消耗大量的溶解氧，形成氮浓度过高，对水体中的动植物造成伤害以及碳水化合物、有毒金属、重金属等。
1 河道污染问题
水污染目前已受到人类高度重视，如今水污染越来越严重，这已经成为威胁人类生存与安全的一个严肃问题。在河水中，受污染的底泥会对小型动物的生存形成威胁，一些有较强毒性的底泥还能够轻而易举的杀死河中有机物，使食物链部分断裂，水污染已严重破坏了整个生态系统的平衡。近年来，生物多样性逐年递减，就算顽强生存下来的物种也会产生许多健康问题，人们应该对此陷入沉思之中。
农村河道不仅是水上交通运输的主要通道，行洪的主要载体，还是很多生物生活的良好栖息地，更是人类赖以繁衍生存的重要物质源泉。可是，经济和科技的发展所带来的就是生态环境的破坏，许多农村河道成为死水潭，水质恶化，大量水生生物的消失，河道生态现状的严重退化，甚至完全消失。
2 河道的管理模式
健康的水循环利用方式主要是指水在循环使用过程中，尊重水的自然运动规律和品质特征，合理科学地使用水资源，将使用过的废水经过深度无害化处理和再生利用。
农村水环境是多方面组合而成的复合的巨系统。整体优化生态治理模式是根据水体的系统特征，从生态、水景观、给水、排水、污水处理、灌溉、航运、再生利用、排涝和文化遗产、旅游等各方面，统筹规划供水、节水与水污染防治，增强水系统的整体性、适配性、扩展性和应急能力，提高系统抗御外部干扰的稳定性，以及具备可靠的供水水源、安全运行的供水排水系统、良好的灌溉用水，满足人居环境相适应的健康水环境等方面的要求。有效地稳定改良水体的生物多样性，提高水体生态自我修复能力，使水体水产品健康无害，野生动植物能健康繁育，人类能在农村河湖中游泳，从而构建农村和谐的水环境。
农村河道有独立自成体系的河流，有交错成网的河流，如平原圩区河道，河道相互交错，各条水系相互沟通，形成较为复杂的水网体系。这些河流有单一小区域的河流，有跨越多个区域的河流。可见，农村河道所涉及的空间尺度是多样的，既有单河道尺度的，又有多河道尺度的，还有流域尺度的。而且这些不同尺度的水体环境是相互影响的，因此，对于水环境的治理不能仅考虑单一尺度，应该多尺度综合治理，既要实施单一河道尺度的重点治理，又要考虑多河道、流域尺度的综合治理、采用联动式治理模式。
产生农村水环境恶化的原因多样，污染是最关键的原因，所以在农村水环境治理过程中应严格控制污染源，严格禁止点源污染的直接排放，严格控制农药、肥料、饵料等污染物使用。
对于污水，应该集中收集、集中处理，积极采用污水集中处理技术、湿地处理技术、生态河岸带缓冲处理技术等相关技术处理生产、生活污水。对于水环境已经恶化的水体，应采取工程与非工程技术加以治理，利用水利工程优化调度技术，活化水体；利用微生物技术消除水体内的污染物质，利用曝气技术增加水体的含氧量，提高水体的自净能力；利用植物技术吸收污染物，利用疏浚技术去除底泥中的污染物质。这些技术措施只有相互配合使用，才能取得更好的效果，所以，治理中应该采取多技术集成的生态治理模式。
3关于河道结构如何进行生态治理
农村河道自然性较强，生态状况保持较好，但是自然河道的防洪能力大多较弱，所以，对这类河道的治理既要充分维护现有的自然生态状况，也要能大大提高河道防洪能力。河道生态治理中，能展现河道特色的关键因素是河道的结构型式，所以河道结构型式的构造是生态河道治理中很重要的一部分。综合各种治理技术和治理措施，农村河道结构的生态治理包括自然生态型河道治理、工程生态型河道治理以及景观生态河道治理三种治理模式。
自然生态型治理是选择适于滨河地带生长的植被种植在河道岸顶、坡面和水边，利用植物的根、茎、叶来固岸。如种植柳树、白杨等具有喜水特性的植物，由它们发达的根系稳固土壤颗粒增加堤岸的稳定性，加之柳枝柔韧，顺应水流，可以降低流速，防止水土流失，增强抗洪、保护河岸的能力。这种模式可以根据当地的地形特点和水文条件，对植物结构和栽植方式做一定的改造。可以采用“土壤生物工程法”，利用木桩与植物梢、棍相结合、植物切枝或植株将其与枯枝及其 他材料相结合、乔灌草相结合、草坪草和野生草种相结合的等技术来防止侵蚀，控制沉积，同时为生物提供栖息地，可以有效地维护河道的自然特性。这种模式适于用地充足，岸坡较缓，侵蚀不严重的河流。在治理过程中，最关键的问题的植物物种的选择与配置。
工程生态型治理模式以防止岸坡冲刷为主，在材料选用上常常采用浆砌或干砌块石、现浇混凝土和预制混凝土块体等硬质且安全系数相对较高的材质。在结构形式上常用重力式浆砌块石挡墙、工形钢筋混凝土挡墙等结构。
景观生态型河道治理模式主要是从满足景观功能的角度对河道加以治理，将河道的生态要求和景观要求综合考虑，充分考虑河道所处的地理环境、风土人情，沿河设置一系列的亲水平台、休憩场所、休闲健身设施、旅游景观、主题广场、艺术小品、特色植物园和各种水上活动区，力图在河道纵向上，营造出连续、动感的“长幅画卷”的景观特质和景观序列；在河道横断面景观配置上，多采用复式断面的结构形式，保持足够的景深效果。
景观生态型治理模式将各种独立的人文景观元素有规律地组合在一起，构成了当地人们的生活方式，它将美学作为一个和谐和令人愉快的整体。充分体现了“以人为本”、“人与自然和谐相处”的理念，符合科学发展观要求。这一治理模式主要适用于城镇居住区内的河道治理中。在我国，水体受到不同程度的污染， 这些污染充斥在城镇、农村各个角落，目前还没有能力投入大量资金进行生态修复，可是，我国从没有停止生态修复的步伐，污染底泥的修复技术更在不断提高，相信在多少年后，农村水利环境一定会得到很大提高的改善，人们的身体健康不再受到污染的威胁。