土木工程专业毕业设计通常需要遵循以下指导：
1. 澄清研究目标与问题：毕业设计最重要的一步是明确研究问题。需要确定研究的目标、研究问题、预期结果和能否得到可行方案。在确定研究问题与目标时应该注意问题的合理性和可行性。
2. 合适的研究方法：选择适当的研究方法是顺利完成毕业设计的关键，需要根据研究问题选择合理、可行的方法，并论证研究的可信度和效度。同时，还应该注重实践性和可操作性，确保研究方法能够得到有效实践。
3. 结合实践、注重实验室和现场操作：土木工程的特点就是注重实践性，因此在毕业设计中也应该注重实验室和现场操作。需要将理论应用到实践中，研究合理的方案对土木实践生产具有指导意义。
4. 编写毕业设计论文：毕业设计除了必须完成实践操作外，还需要完成论文的编写。为了使论文质量较高，需要注意论文格式正确与书写风格，引用文献的类型、数量和质量，以及语言表达是否简洁、准确。
5. 实现团队协作：在毕业设计过程中，学生可能需要与导师、同学进行一定的协作，需要在思想上和工作中建立团队意识，加强沟通，尽可能地协调好大家之间的安排。