在履行建设工程合同的实践中，工程款的结算问题是承包人与发包人之间产生争议最多的问题。常常发生发包人有意规避逾期付款的违约责任干脆不进行工程结算，使发包人与承包人的债权长期处于一个不确定的状态，从而达到长期拖欠工程款的目的。在司法实践中，往往是承包人拿着合同约定的结算文件，请求人民法院按照结算文件中形成的工程款数额，请求判令发包人承担支付工程款的责任。而发包人却提出，竣工结算文件是承包人单方作出的，没有经过中介机构的评估和鉴定。因结算报告的递交手续不完备、不规范，结算程序的事实认定困难。
从而导致案件审理期限的拖延，增加了当事人的诉累。那么，如何才能化解长期困扰建设工程合同中承包人结算难的风险呢？为了解决此类问题，法律给了承包人一把“尚方宝剑”，2005年1月1日生效的《最高人民法院关于审理建设工程合同纠纷案件适用法律问题的解释》第二十条规定：“当事人约定，发包人收到竣工结算文件后，在约定期限内不予答复，视为认可竣工结算文件的，按照约定处理。承包人请求按照竣工结算文件结算工程价款的，应予支持。”这一规定明确规定了发包人逾期对承包人提交的竣工结算文件既不答复也不结算的法律后果，对发包人无限期拖延结算的行为进行了具体的制约，也就是说承包人依法送交规范的竣工结算文件，可以依法转变成工程款结算的法定依据。这对于承包人依法维护自己的合法权益来讲无疑是一把“尚方宝剑”。但是，承包人如何才能正确应运好这把“尚方宝剑”来化解结算难的风险，应当注意以下几个问题。否则，操作不当，将会导致不利或适得其反。
一、应注意建设工程合同中对竣工结算条款的约定
合同是发包人和承包人双方形成权利义务的法律文件，不但受法律保护，而且是双方行使权利和履行义务的根据，所以首先要将有关竣工结算的条款约定清楚明确。
如果是采用建筑行业的规范和标准的合同范本，那就按照建设部制定的建设工程施工合同格式文本规定的有关条款，有关竣工结算文件形成的过程的约定大体如下：
（1）、工程竣工验收报告经发包人认可后28天内，承包人向发包人递交竣工结算报告及完整的结算文件资料，双方按照协议书约定的合同价款及专用条款约定的合同价款调整内容，进行工程竣工结算。
（2）、发包人收到承包人递交的竣工结算报告及结算资料后28天内进行核实，给予确认或者提出修改意见。发包人确认竣工结算报告后通知经办银行向承包人支付工程竣工结算价款。承包人收到竣工结算价款后14天内将竣工工程交付发包人。
（3）、发包人收到竣工结算报告及结算资料后28天内无正当理由不支付工程竣工结算价款，从第29天起按承包人同期向银行贷款利率支付拖欠工程价款的利息，并承担违约责任。
（4）、发包人收到竣工结算报告及结算资料后28天内无正当理由不支付工程竣工结算价款，承包人可以催告发包人支付结算价款。发包人在收到竣工结算报告及结算资料后56天内仍不支付的，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以由承包人申请人民法院将该工程依法拍卖，承包人就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。
（5）、工程竣工验收报告经发包人认可后28天内，承包人未能向发包人递交竣工结算报告及完整的结算资料，造成工程竣工结算不能正常进行或工程竣工结算价款不能及时支付，发包人要求交付工程的，承包人应当交付；发包人不要求交付工程的，承包人承担保管责任。
（6）、发包人和承包人对工程竣工结算价款发生争议时，按通用条款中有关争议的约定处理。
如果没有采用建设部规定的示范合同，而是，双方另行约定的合同，或采用国际惯例的合同，则承包人尤其更应高度重视对结算条款的约定。承包人在签订建设工程合同中应当与发包人明确约定：发包人在收到竣工结算文件后，在约定期限内不予答复的，视为认可竣工结算文件。比如：“工程验收竣工后，乙方提出工程结算并将有关文件资料送交甲方，甲方自接到上述文件天内审查完毕，到期未答复，视为同意”。或在专用条款中约定：“如果发包人逾期不予答复的，按照建设部第107号令《建设工程施工发包与承包计价管理办法》规定处理”。也可引用财建（2004）369号《建设工程价款结算暂行办法》，但在引用时承包人应注意其中有关承包人应尽的义务。
二、应注意发包人对承包人提交的建设工程合同的最终结算资料签收的问题
承包人递交竣工结算报告资料和发包人收到竣工结算报告资料行为的确认是非常重要的。按照建设工程施工合同约定和惯例，承包人给发包人递交的结算报告应当是书面的，发包人收到承包人递交的竣工结算报告也必须给承包人出具书面的凭证。如果承包人仅仅口头告知发包人有关结算报告的内容等，是不产生导致结算依据的后果。而且如果仅仅是口头的单方告知，也会导致在日后发生工程款结算纠纷时举证的困难。承包人向发包人递交结算报告时，接收结算报告的主体如果是法人或者其他组织的，应当是该法人的法定代表人、其他组织的主要负责人，或者建筑承包合同中约定的具体的代理人和地址，或者法人或其他组织内部具有收发责任和义务的部门，如办公室、收发室、值班室负责收件的人签收或者盖章。递交结算报告的不适用留置递交的方式。在司法实践中，承包人以发包人不接收结算报告为由，主张由其单方提出的结算报告作为结算工程价款的依据，理由不能成立，法院一般不予支持。如果承包人不能举出证据证明自己已经向发包人递交了结算报告，则不能产生将承包人提出的结算报告作为最终结算依据的法律后果。
三、应注意承包人对发包人怠于履行付款义务的催告问题
履行催告是否属于承包人履行的义务问题。在建设工程施工合同格式文本中，规定发包人收到竣工结算报告及结算资料后28天内无正当理由不支付工程竣工结算价款，从第29天起按承包人同期向银行贷款利率支付拖欠工程价款的利息，并承担违约责任的同时，还规定了发包人收到竣工结算报告及结算资料后28天内无正当理由不支付工程竣工结算价款，承包人可以催告发包人支付结算价款的内容。从民法理论尤其是《合同法》规定来看，催告往往是一种产生一定法律后果的前提，而且有一个合理期限。但需要注意的是，在建设工程施工合同格式条款中，催告行为是与产生付款并承担相应工程款利息，在建设工程施工合同范本中是被同时规定的。也就是说，承包人向发包人进行催告并不是产生结算依据的前置程序，不是一个必经的程序。司法实践中，发包人不得以承包人没有进行催告而提出抗辩。所以最高人民法院司法解释中没有规定催告作为确定结算依据的前置程序，但并不影响承包人向发包人就工程款支付事宜进行催告。然而，需要承包人特别注意的是催告函是要求发包人支付工程款而非督促结算。
总之，如果操作的规范，则承包人的工程款结算风险，会随之化解，并可以防止发包人久拖不结工程款的行为发生，还可减少承包人的经济损失，早日收回应收的资金，如果操作不当又可适得其反。所以，承包人如何防止发包人拖欠工程款，如何利用好法律赐给承包人的“尚方宝剑”是一项十分专业而仔细的事务。一定要引起承包人的高度重视。