竣工决算审计是政府投资项目管理的最后一道关口，是项目全过程造价管理的关键环节，也是审计机关需要积极防控的重要审计风险点。 审计人员应重点了解决算编制工作的责任单位，其编制依据是否符合国家有关规定，资料是否齐全，手续是否完备，对项目遗留问题的处理是否合规。重点关注实际投资核算，包括建安工程投资、设备投资、待摊投资核算的真实和准确，待摊投资支出的合法、合规性以及分摊方法的合理性，特别是建设单位管理费、勘察设计费、土地征用费等前期费用的核算、分摊是否合法、合规。 在取得项目的竣工决算表后，整理汇总一个概算与实际投资的对比明细表，将其中实际投资与概算投资出入较大的单项工程作为审查的重点，在此基础上逐项分析超概算或节约的具体内容与原因，比如是否存在概算外项目和扩大工程规模、提高建设标准的情况，有无重大工程质量事故和经济损失或投资浪费等情况。 根据项目设计概算批复，审核建设资金来源是否与设计概算内容一致，工程建设过程中建设资金到位情况等。 重点关注交付使用财产是否真实、完整，移交手续是否齐全、合规，其中切勿忽略各类备品配件、工器具等的交付移交；同时关注大额无形资产、流动资产、铺底流动资金是否真实、正确。 重点审查成本核算是否完整，关注有无挤占工程成本，提高工程造价，转移建设投资的问题，实际审计中应注意以下若干问题： ①整体把握建安工程成本。重点关注各类设计变更、现场签证、材料价差等工程结算，特别是工程结算时对于各类成本费用的调增调减，通过审查其支撑性资料来判断其真实性，分析合法合规性，对于提交的结算资料有疑点的可具体延伸资料提交方，要求提供资料原件和相应的财务会计资料。 ②重点核查施工工程量。通过比对招标工程量、施工图量、竣工图量，结合设计变更或工程联系单的具体内容，来核查分析施工工程量的准确性。由于工程量的计算量大且繁琐，可以有重点地审查投资比例较大的分项工程，如混凝土结构梁、板、柱、钢结构等，和容易混淆或出漏洞的项目，如建筑工程中的内外墙体、面积应以实砌体积计算。此外，工程量的计算也可作为评价设计单位工作质量的依据。 ③审核工程物资材料用量及价差。物资材料用量审核，根据基本建设项目的特征选择主要工程材料，审查主要材料采购合同、入库单或施工现场接收单（如施工、监理、厂家、甲方代表的四方签证量）、耗量表等。由于各地市场材料价格不一且波动较大，材料的价差审核有一定难度，特别是时间较早的工程项目取证的困难性更大。具体而言，材料价差应依照定额用量、实际消耗量和预算定额单价、实际单价分析计算。 根据修正总概算和工程形象进度，核实尾工工程的未完工作量和投资，如是否经有关部门核实或审批，尾工工程与预留尾工资金是否相匹配。防止将概算外新增项目列作尾工项目，挤占工程投资，或者是大量预留尾工资金的情况。 关注列支依据是否充分，手续是否完备，内容是否真实，核销是否合规，有无虚列投资的问题。 审查实际投资是否控制在总投资之内，未使用的工程物资的账务处理是否得当。重点审核库存物资，防止隐匿、转移、挪用库存物资。审查是否存在虚列债权债务，隐匿、转移项目结余资金的问题。 包括各项工程建设副产品的变价收入、试生产收入，以及各项索赔和违约金等其他收入，相关收入是否及时入账，核算是否真实、完整，有无隐匿、转移收入的问题。是否按照国家相关规定计算分成，足额上缴或归还建设贷款。 根据对设计概算的执行情况的分析，正确核算项目包干节余指标，防止将未完工程的投资作为包干结余参与分配。
近年来，建设工程领域查处的很多重大腐败案件，或与项目竣工决算管理混乱有着直接或间接的关系。参与政府投资项目建设的承包商为获取更丰厚的经济利益，必然会在竣工决算环节动起“歪脑筋”。在建设项目审计中，一个很重要的内容就是项目的竣工决算审计，在实施这项审计时，应该关注把握以下这十个主要关键点：